America-Places.com a répertorié environ 5 parcs nationaux dans Putumayo. Certains des mieux notés parcs nationaux dans Putumayo sont- Parc national naturel de la Serrania de los Churumbelos Auka-Wasi, Parc central de Puerto Limón, La cascade du bout du monde / Cascada Fin Del Mundo, Parc Général Santander & Parc naturel national de La Paya.